Естественно-математические науки
Теоретическая атомная, молекулярная, мезоструктурная и наноструктурная физика
Руководитель — Беляев Андрей Константинович, доктор физико-математических наук, профессор.
Физика конденсированного состояния
Руководитель — Бордовскийй Геннадий Алексеевич, заслуженный деятель науки РФ, академик РАО, доктор физико-математических наук, профессор.
Физика полимерных композитных материалов
Основатель — Гороховатский Юрий Андреевич, заслуженный деятель науки РФ, доктор физико-математических наук, профессор.
Физика полуметаллов и низкоразмерных структур на их основе
Руководитель — Грабов Владимир Минович, заслуженный деятель науки РФ, доктор физико-математических наук, профессор.
Квантовая теория поля
Основатель — Гриб Андрей Анатольевич, доктор физико-математических наук, профессор.
Гуманитарные науки
Проблемы подготовки и аттестации научно-педагогических кадров
Руководитель — Лаптев Владимир Валентинович, заслуженный деятель науки РФ, академик РАО, доктор педагогических наук, профессор.